A APAE de Niterói é uma associação civil, filantrópica, de caráter assistencial, educacional, cultural, de saúde, de estudo e pesquisa, desportivo e outros, sem fins lucrativos, com duração indeterminada, ocupa um prédio próprio da Prefeitura Municipal de Niterói, cedido por unanimidade em sessão da Câmara realizada em 26 de abril de 1976, situada na Rua Professor Ismael Coutinho, s/n – Centro Niterói RJ. Mantém ainda, uma sede própria na Estrada do Viçoso Jardim, 30 - Cubango - Niterói - RJ, onde se instala o Núcleo Profissionalizante para atender à demanda reprimida do Município de Niterói.
Fundada em 02 de agosto de 1965, sob o incentivo da professora Rosa Abi Ramia Haddock Lobo, sendo nomeada como APAE de Niterói e São Gonçalo, teve como seu primeiro presidente o senhor Wolney Bastos e em 29 de julho de 1967, assumiu a presidência a professora Rosa Abi Ramia Haddock Lobo.
Durante este período, a APAE trabalhou junto aos pais orientando-os enquanto se preparava para um atendimento direto à criança. Em 16 de dezembro de 1968, com auxílio da família Scisinio Dias, que emprestou uma loja, e do Nosso Grupo que doou as mesas para fisioterapia, passamos a atender três crianças em tratamento de reabilitação motora.
O desenvolvimento foi rápido e, em seis meses a APAE, necessitando de mais espaço para um melhor atendimento, transferiu-se para a Rua Alexandre Moura em São Domingos, e a pedido da Federação Nacional das APAEs, passou a ser chamar apenas APAE Niterói, já que sua localização é em Niterói.
A APAE de Niterói, atende hoje cerca de 225 alunos, com Deficiência, de zero ano a idade adulta, nos seguintes setores: Estimulação Precoce, Escola/CRIAR, Inclusão, CIAPA (Centro de Integração e Atendimento ao Psicótico e Autista) CAA (Comunicação Alternativa e Ampliada) e Núcleo Profissionalizante e recebem os seguintes atendimentos: Serviço Social, Fisioterapia, Fisioterapia-Respiratória, Fonoaudiologia, Terapia Ocupacional, Psicologia, Pedagogia, Educação Física, Nutrição, Odontologia, Psiquiatra e Clínica Médica. No trabalho de Profissionalização realizado no Núcleo Profissionalizante, os Jovens e Adultos recebem, além dos atendimentos terapêuticos e pedagógicos, treinamento em oficinas profissionalizantes como: marcenaria, cozinha, faxina, confeitaria, artesanato, reciclagem e uma Padaria Escola.
A APAE de Niterói, realiza um trabalho de higienização e restauração de livros e obras raras, com empresas como: Centro Cultural Banco do Brasil que é realizado por alunos com Deficiência, orientados por técnicos e auxiliares na área de preservação de bens culturais, dando oportunidade à inserção de nossos alunos no mercado de trabalho. É importante saber que, a pessoa com deficiência, devidamente preparada, encontrará oportunidades no mercado de trabalho competitivo.
A APAE de Niterói, está desde janeiro/2011 sob a direção de MARCOS MOUTINHO CABRAL, em seu segundo Mandato reeleito para o exercício em 201/2013. buscando com empenho e dedicação o seu crescimento, visando sempre a integração e a participação dos pais, profissionais, amigos e da comunidade, em prol da Pessoa com Deficiência.