Fundada em 02 de agosto de 1965, a APAE de Niterói ocupa um prédio próprio da Prefeitura Municipal de Niterói, cedido por unanimidade em sessão da Câmara realizada em 26 de abril de 1976, situada na Rua Professor Ismael Coutinho, s/n – Centro Niterói RJ. Existe uma sede própria na Estrada do Viçoso Jardim, 30 - Cubango - Niterói - RJ, onde se instalava o Núcleo Profissionalizante para atender a demanda do Município de Niterói. Este local, desde julho de 2012, lamentavelmente, encontra-se fechado pela falta de recursos para sua manutenção. Todos os pacientes do Núcleo Profissionalizante foram alocados no 3º andar da Sede, no Centro.
A APAE de Niterói, atende cerca de 200 alunos com Deficiência Intelectual e Mental, de zero ano a idade adulta, nos seguintes setores: Estimulação Precoce, CAM(Centro de Atendimento Multidisciplinar), Inclusão, CIAPA (Centro de Integração e Atendimento ao Autista e Psicótico, Ambulatório, CECAA (Centro de Estimulação, Comunicação Alternativa e Ampliada) com os atendimentos de: Fisioterapia, Fisio-Respiratória, Fonoaudiologia, Terapia Ocupacional, Psicologia, Pedagogia, Serviço Social, Nutricionista, Odontologia e Neurologista(em contratação), Psiquiatria, Clínica Médica, Desporto, Oficinas de Treinamento(Confeitaria, Faxina, Cozinha, Reciclagem, Artesanato) Capoeira e Banda Marcial e, ainda, os seguintes Projetos na instituição: Coral Canta Esperança, Cozinha Inteligente, Artesanato e Palestras, oferecidos às mães. Bazar Permanente e a Feira de Livros no Campo de São Bento.
A APAE de Niterói, está sob a direção de NORMA CORRÊA PIRES, em sua segunda gestão, que compõe o período de 1º de janeiro de 2014 até 31 de dezembro de 2016, buscando com empenho e dedicação o seu crescimento, visando sempre a integração e a participação dos pais, profissionais, amigos e a Comunidade, em prol da Pessoa com Deficiência.
